微生物學通報雜志收錄論文類型主要包括：研究快報、研究報告_工業微生物學、研究報告_海洋微生物學、研究報告_環境微生物學、研究報告_基礎微生物學、其他、研究報告_農業微生物學、研究報告_獸醫微生物學、研究報告_藥物微生物學、研究報告_醫學微生物學、簡報、專論與綜述、高校教改縱橫等。
雜志論文要求：
1、一、二、三級標題各占一行，其中一級標題居中，二、三級標題縮進兩個字符且左對齊，四級及以下標題后加句號且與正文接排。
2、引用的參考文獻應為最近5年內發表的，且一般要求5篇以上；另外，參考文獻著錄采用順序編碼制，即按在正文中被引用的先后順序排列。
3、論文關鍵詞是從報告、論文中選取出來，用來表示全文主題內容信息款目的單詞和術語。每篇論文應選取3～5個關鍵詞。
4、稿件請附作者簡介，主要內容有：姓名、性別、工作單位與部門、職稱或職務、研究方向、通信地址、聯系方式（電話及郵箱）。
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雜志往期論文摘錄展示
中國東海和南海海域可培養烴類降解細菌的篩選及功能
靜態好氧高溫牛糞堆肥中nirK型反硝化細菌群落動態變化
光氧環境對紫色硫細菌YL28去除無機三態氮的影響
“微”故事——微生物的前世今生
模擬油藏條件下內源微生物群落空間分布規律
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