雜志的級別劃分是一個相對復雜的過程，涉及多個方面的因素，對于《分子植物育種》雜志來說，其級別劃分主要基于其在期刊行業內的認可度、學術影響力以及收錄和榮譽情況等因素。
級別劃分依據主要基于以下幾個方面：
主管與主辦單位
《分子植物育種》雜志海南省科學技術協會主管，海南省生物工程協會主辦，根據期刊級別劃分的標準，部級期刊由國家部委、全國性學會、協會、研究機構等主辦，具有全國影響力。而省級期刊則由各省、自治區、直轄市及其下屬部門、學會、協會、高等院校等主辦，包括本科院校和專科院校的學報。
收錄與榮譽
收錄情況：該雜志被多個知名數據庫和圖書館收錄，如北大期刊(中國人文社會科學期刊)、統計源期刊(中國科技論文優秀期刊)、知網收錄(中)、維普收錄(中)、萬方收錄(中)、CA 化學文摘(美)、JST 日本科學技術振興機構數據庫(日)、國家圖書館館藏、上海圖書館館藏等。這些數據庫的收錄標準通常較高，能夠反映出《分子植物育種》雜志的學術質量和影響力。
榮譽資質：該雜志榮獲了中國優秀期刊遴選數據庫、中國期刊全文數據庫（CJFD）、中國科技期刊優秀期刊、北大圖書館收錄期刊等榮譽。這些榮譽資質的獲得，進一步證明了期刊的學術水平和影響力。
學術影響力
總發文量與被總被引量：《分子植物育種》雜志總發文量：6671，總被引量：25503，總發文量與被總被引量是衡量其學術影響力的重要指標。
影響因子：該雜志的綜合影響因子：0.89，復合影響因子：0.85，這進一步證明了其學術水平和影響力。
期刊欄目設置
欄目設置：《分子植物育種》雜志涵蓋了基因組學及功能基因_研究報告、基因組學及功能基因_評述與展望、基因工程育種_研究報告、標記輔助育種_研究報告、現代遺傳育種_研究報告、表型性狀與分子性狀_研究報告種質資源_研究報告、田間試驗與栽培技術_研究報告、田間試驗與栽培技術_評述與展望等多個欄目，內容新穎、信息量大、時效性強，能夠滿足不同領域學者的需求。
投稿咨詢綜上所述，該雜志的級別劃分依據主要基于其主管與主辦單位的學術地位、收錄與榮譽情況、學術影響力以及期刊內容與欄目設置等多個方面。
這些因素共同構成了雜志級別劃分的重要依據，也體現了《分子植物育種》雜志作為一本具有較高學術水平和影響力的北大期刊的地位。
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